1. DNA:n ja geneettisen tiedon uudelleen organisointi. Miten ja miksi? (10 p.)

2. Pre-initiaatiokompleksin muodostuminen transkription aloituksessa. Merkittävimmät erot alkeis- ja aitotumallisten solujen välillä? (10 p.)

3. Katalyyttinen RNA. (10 p.)

4. Selitä tai määrittele lyhyesti seuraavat termit tai käsitteet (10 p.):

a. Cot_1/2 (2 p.)
b. RNAn muotoilu (RNA editing) (2 p.)
c. klatriinilla vuoratut vesikkelit (chlatrin-coated vesicles) (2 p.)
d. G-proteiinit (2 p.)
e. proto-onkogeenit (proto-oncogenes) (2 p.).

5. Olet eristänyt ja sekvensoinut ns. "narkomaanistirotasta" (Alkon kehittämä uusi rottakanta) "hdh"-geenin, jonka tuottamalla entsyymillä (hasisdehydrogenaasi) arvellaan olevan tärkeä merkitys huumeriippuvuuden synnyssä. Geenin koko pituus näyttäisi olevan ainakin 7600 bp, Aloituskodoni (AUG) on toisessa eksonissa ja lopetuskodoni (TAA) neljännessä eksonissa. HDH-ensyymin raken- netta, toimintaa tai sijaintia eri kudoksissa ei ole aiemmin kuivattu kirjallisuudessa. Olet aloittamassa HDH-entsyymin ominaisuuksia selvittävää tutkimusta, jonka keskeisimmät tavoitteet ovat:

1. HDH-entsyymin biokemiallisten ominaisuuksien selvittäminen,
2. HDH-entsyymin sijainnin selvittäminen rotan eri soluissa ja kudoksissa, ja
3. HDH-mRNA:n ilmentymisen säätely hasis-altistuksen yhteydessä.

Kirjoita kuvaus tutkimuksen eri vaiheista ja etenemisestä. Millaisia menetelmiä valitsisit ja miksi? Onko metodisia vaihtoehtoja? Yritä edetä loogisessa järjestyksessä. Metodisia yksityiskohtia ei tarvitse kuvata (10 p.)